刘宋十三
南朝宋这一家子杀来杀去图了个啥？这不，宋明帝刚登上皇位，藩王又开始作乱了。到了公元466年春季，正月初一，己丑朔日，北魏实行大赦，并改年号为天安。
正月初五，朝廷征召会稽太守、寻阳王刘子房担任抚军将军，同时任命巴陵王刘休若接替他的职位。
正月初六，朝廷内外实行戒严。任命司徒、建安王刘休仁都督征讨诸军事，车骑将军、江州刺史王玄谟担任副职。刘休仁驻军于南州，任命沈攸之为寻阳太守，领兵驻扎在虎槛。当时王玄谟大军尚未出发，前锋共有十支军队，陆续抵达前线。各军每晚都自立暗号，互不统属、不相通报。沈攸之对众将领说：“如今各军暗号不同，若有农夫、渔夫夜间相互呵斥，就会导致军中惊骇混乱，这是招致失败的做法。请统一沿用一支军队的暗号。”众将全都听从了他的建议。
此时，邓琬大肆宣扬祥瑞征兆，谎称接到路太后的玺书，率领将领僚属向晋安王刘子勋奉上尊号。正月初七，刘子勋在寻阳登基称帝，改年号为义嘉。任命安陆王刘子绥为司徒、扬州刺史；寻阳王刘子房、临海王刘子顼一同加授开府仪同三司；任命邓琬为尚书右仆射，张悦为吏部尚书，袁顗加授尚书左仆射；其余将领僚属及各州郡官员，分别得到不同等级的任命和爵位晋升。
正月初八，朝廷任命征虏司马申令孙为徐州刺史。申令孙是申坦的儿子。在义阳设置司州，任命义阳内史庞孟虬为司州刺史。
徐州刺史薛安都、冀州刺史清河人崔道固都起兵响应寻阳的刘子勋。皇上向青州刺史沈文秀征兵，沈文秀派遣将领平原人刘弥之等人领兵赶赴建康。恰逢薛安都派遣使者邀请沈文秀，沈文秀便改令刘弥之等人响应薛安都。济阴太守申阐占据睢陵响应建康朝廷，薛安都派遣侄子、直阁将军薛索儿，太原太守、清河人傅灵越等人进攻睢陵。申阐是申令孙的弟弟。薛安都的女婿裴祖隆驻守下邳，刘弥之抵达下邳后，转而率领所部响应建康，袭击裴祖隆。裴祖隆兵败，与征北参军垣崇祖逃奔彭城。垣崇祖是垣护之的侄子。刘弥之的族人、北海太守刘怀恭，侄子刘善明都起兵响应刘弥之，薛索儿得知这个消息后，便放弃睢陵，领兵攻击刘弥之。刘弥之战败，逃奔北海据守。申令孙进占淮阳，向薛索儿请求投降。庞孟虬也拒不接受朝廷任命，起兵响应寻阳。
明帝征召寻阳王长史、代理会稽郡事务的孔觊担任太子詹事，任命平西司马庾业接替他的职位；又派遣都水使者孔璪前往东部慰劳。孔璪劝说孔觊：“建康兵力薄弱，不如据守会稽、吴郡、吴兴、义兴、晋陵五郡，响应袁顗、邓琬。”孔觊于是起兵，急传檄文拥戴寻阳的刘子勋。吴郡太守顾琛、吴兴太守王昙生、义兴太守刘延熙、晋陵太守袁标都占据本郡响应孔觊。明帝又任命庾业接替刘延熙担任义兴太守，庾业行至长塘湖，立即与刘延熙会合。
益州刺史萧惠开得知晋安王刘子勋起兵，便召集将领僚属说：“湘东王（刘彧）是太祖的嫡孙（昭为宗庙左列，指太祖后裔）；晋安王（刘子勋）是世祖的嫡孙（穆为宗庙右列，指世祖后裔），二人都有资格继承皇位。但景和帝（刘子业）虽然昏庸，本是世祖的子嗣；即便他不能胜任社稷之主，世祖的后裔还有很多。我蒙受世祖的恩宠，应当拥戴九江的晋安王。”于是派遣巴郡太守费欣寿率领五千人东下。此后，湘州行事何慧文、广州刺史袁昙远、梁州刺史柳元怙、山阳太守程天祚都归附了刘子勋。柳元怙是柳元景的堂兄。
这一年，各地的贡品和赋税都送往寻阳，朝廷所保住的，只有丹阳、淮南等几个郡，其中有些县还响应刘子勋。东部叛军已抵达永世，宫廷和朝廷都陷入恐慌。明帝召集大臣商议事情的成败。蔡兴宗说：“如今天下一同反叛，人人怀有异心。应当以镇静安抚局势，以最大的诚信对待他人。反叛者的亲戚遍布宫廷和朝廷，如果依法惩处他们，就会立即导致土崩瓦解，应当明确罪责不牵连他人的原则。民心安定之后，人们就会有作战的决心，朝廷禁军精锐勇猛，武器铠甲锋利，用来对付没有作战经验的叛军，形势相差悬殊。希望陛下不要忧虑。”明帝认为他说得对。
建武司马刘顺劝说豫州刺史殷琰响应寻阳，殷琰因家人在建康，没有同意。右卫将军柳光世从宫中逃出投奔彭城，路过寿阳时，声称建康必定守不住。殷琰相信了他的话，而且自己素来没有亲信部曲，又被当地豪强、前右军参军杜叔宝等人控制，不得已而顺从。殷琰任命杜叔宝为长史，内外军事都由杜叔宝专断。明帝对蔡兴宗说：“各处尚未平定，殷琰又反叛了；近日民心如何？事情能成功吗？”蔡兴宗说：“叛逆与忠顺，我无法分辨。如今商旅断绝，但粮食却十分充足且价格低廉，各地叛军云集，而民心反而更加安定。由此推断，平定叛乱是必然的。但我所担忧的，更在平定之后，就像羊祜所说：‘平定之后，才更要劳烦陛下思虑啊。’”明帝说：“确实如你所言。”明帝知道殷琰归附寻阳并非本意，于是更加优厚地安抚他的家人，以便招降他。
汝南、新蔡二郡太守周矜在悬瓠起兵响应建康。袁顗引诱周矜的司马、汝南人常珍奇活捉周矜，并将其斩首，任命常珍奇接替太守职位。
明帝派遣冗从仆射垣荣祖返回徐州劝说薛安都，薛安都说：“如今京都周围不足百里之地还在朝廷控制之下，且不说攻城取胜易如反掌，我也不想背叛孝武帝（刘子业之父，刘子勋祖父）。”垣荣祖说：“孝武帝的所作所为，足以招致祸殃，如今虽然天下人一同反叛，但这正是加速灭亡，不会有什么作为。”薛安都不听，反而留下垣荣祖让他担任将领。垣荣祖是垣崇祖的堂兄。
兖州刺史殷孝祖的外甥、司法参军颍川人葛僧韶，请求让殷孝祖入朝，明帝派遣他前往。当时薛索儿占据了交通要道，葛僧韶从小路得以抵达，劝说殷孝祖：“景和帝凶残暴虐，是开天辟地以来所未有之；朝野上下危在旦夕，性命仅存片刻。主上（刘彧）平定凶暴，再造天地，国家混乱、朝廷危难之时，应当拥立年长的君主。而一群糊涂人相互煽动，无端制造事端，贪图拥立幼主的利益，争相抱有非分之想。如果天道帮助叛逆，群凶得逞，那么主上年幼、时局艰难，权力不统一，战乱将接连发生，哪里还有我们的容身之地！舅舅年轻时就有立功的志向，若能率领兖州的精锐之师，返回拥戴朝廷，不仅能辅佐君主、平定叛乱，还能名垂青史。”殷孝祖详细询问了朝廷的消息，葛僧韶随机应变地回答和开导，并陈述朝廷军队精锐强盛，主上打算委任他为前锋主将。殷孝祖当天就把妻子儿女托付在瑕丘，率领文武官员二千人，跟随葛僧韶返回建康。当时各地都归附了寻阳，朝廷只保住了丹阳一郡；而永世县令孔景宣又反叛，义兴叛军即将抵达延陵，朝廷内外忧虑危急，众人都想逃散。殷孝祖突然到来，兵力不少，且都是北方和楚地的壮士，人心大为安定。正月十六日，朝廷晋升殷孝祖为抚军将军，假节、督前锋诸军事，派遣他前往虎槛，赏赐十分丰厚。
起初，明帝派遣东平人毕众敬前往兖州招募兵士，毕众敬抵达彭城后，薛安都用利害关系劝说他，伪造皇上的命令让毕众敬代理兖州事务，毕众敬听从了他。殷孝祖派司马刘文石驻守瑕丘，毕众敬领兵袭击并杀死了刘文石。薛安都素来与殷孝祖有矛盾，便让毕众敬杀害了殷孝祖的几个儿子。兖州境内都归附了薛安都，只有东平太守申纂占据无盐，拒不从命。申纂是申钟的曾孙。
正月十八日，明帝亲自统领军队，出宫驻扎在中堂。正月二十三日，任命山阳王刘休佑为豫州刺史，督辅国将军彭城人刘勔、宁朔将军广陵人吕安国等各路军队向西讨伐殷琰。巴陵王刘休若督建威将军吴兴人沈怀明、尚书张永、辅国将军萧道成等各路军队向东讨伐孔觊。当时将士大多是东部地区的人，父兄子弟都已归附孔觊。明帝于是在送军出征时，向众人宣告：“朕正致力于以德治国、减轻刑罚，使父子兄弟罪责互不牵连，归顺朝廷或依附叛逆，一律以本人的选择为判断标准。你们应当深刻理解朕的心意，不要为亲戚的安危担忧。”众人于是大为喜悦。凡是反叛者在京城的亲戚党羽，都让他们像往常一样担任官职。
正月二十四日，路太后去世。
孔觊派遣他的孙子孔昙瓘等人驻军于晋陵九里，军阵十分盛大。沈怀明抵达奔牛，所率领的兵力薄弱，于是修筑营垒固守。张永抵达曲阿，不知道沈怀明是否安全；百姓惊慌骚乱，张永退回到延陵，靠近巴陵王刘休若，众将领都劝说刘休若退保破冈。当天，天气极为寒冷，风雪猛烈，堤坝决口损坏，士兵们没有固守的决心。刘休若宣告命令：“敢说撤退的人斩首！”军心才稍稍安定，于是修筑营垒休整军队。不久便收到沈怀明的书信，得知叛军尚未推进，军主刘亮又率军赶到，兵力逐渐强盛，人心才安定下来。刘亮是刘怀慎的曾孙。
殿中御史吴喜曾以主书的身份侍奉世祖（刘骏），逐渐升迁至河东太守。到这时，他请求率领三百名精兵，前往东部拼死作战。明帝任命吴喜为建武将军，挑选羽林军中的勇士配属给他。议论的人认为“吴喜是掌管文书的官吏，从未担任过将领，不可派遣。”中书舍人巢尚之说：“吴喜过去跟随沈庆之，多次经历军旅之事，性情既勇猛果断，又熟悉战阵；如果能任用他，必定会有成效。众人对此议论纷纷，都是不能识别人才罢了。”于是派遣吴喜出征。吴喜先前多次奉命出使东吴，性情宽厚，所到之处的百姓都感念他。百姓听说吴河东（吴喜）前来，都望风而降或四散逃离，因此吴喜所到之处都能取胜。
永世县人徐崇之攻打孔景宣，将其斩首，吴喜任命徐崇之代理永世县事务。吴喜抵达国山，遭遇东部叛军，便立即发起攻击，大败叛军。从国山进军驻扎在吴城，刘延熙派遣将领杨玄等人抵御。吴喜兵力十分薄弱，而杨玄等人兵力强盛。吴喜奋力出击，斩杀杨玄，进逼义兴。刘延熙构筑栅栏截断长桥，据守郡城自保，吴喜修筑营垒与他对峙。
庾业在长塘湖口两岸修筑城池，拥有七千兵力，与刘延熙遥相呼应。沈怀明、张永与晋陵的叛军相持不下，久战不决。外监朱幼举荐司徒参军督护任农夫勇猛果敢有胆识，明帝配给他四百人，让他协助东部讨伐叛军。任农夫从延陵出发前往长塘，疾驰进攻庾业的城池，奋力作战，大败庾业，庾业弃城逃奔义兴。任农夫收缴了他的船只和武器，向义兴进军，援助吴喜。二月初一，己未朔日，吴喜渡过河水攻打义兴郡城，分兵攻击各个营垒，他亲自登上高处指挥，仿佛下令四面同时进攻。义兴城中百姓大为恐惧，各营垒都溃散了。刘延熙投水而死，于是攻克义兴。
北魏丞相、太原王乙浑独揽朝政大权，诛杀了许多官员。安远将军贾秀掌管吏部事务，乙浑多次对贾秀说，要为自己的妻子请求公主封号，贾秀回答：“公主岂是普通姓氏之人配称的！我贾秀宁愿今日去死，也不愿让后世取笑！”乙浑大怒，骂道：“老奴才做官，太吝啬了！”恰逢侍中拓跋丕告发乙浑谋反，二月初二，冯太后抓捕乙浑，将其诛杀。贾秀是贾彝的儿子；拓跋丕是烈帝拓跋翳槐的玄孙。接着，冯太后临朝听政，任命中书令高允、中书侍郎渔阳人高闾以及贾秀一同参与朝政决策。
这时，沈怀明、张永、萧道成等率军驻扎在九里以西，与东部叛军相持。东部叛军得知义兴兵败，全都震惊恐慌。皇上派遣积射将军济阳人江方兴、御史王道隆前往晋陵视察东部军情。孔觊的部将孙昙瓘、程扞宗等人修筑了五座城池，相互连接呼应。程扞宗的城池还未加固，王道隆与各位将领商议说：“程扞宗的城池尚未建成，正好可以乘机攻取，上能不负皇上旨意，下能鼓舞军心士气。”二月初三，王道隆率领所部紧急进攻，攻克城池，斩杀程扞宗。张永等人乘胜进击孙昙瓘等，二月初四，孙昙瓘等兵败，与袁标一同弃城逃走，于是攻克晋陵。
吴喜率军抵达义乡。孔璪驻扎在吴兴南亭，太守王昙生前往孔璪处商议事务；得知朝廷军队已经逼近，孔璪大为恐惧，从床上摔下来，说：“朝廷悬赏捉拿的人，只有我而已；如今不赶紧逃走，就要被人擒获了！”于是与王昙生逃奔钱唐。吴喜进入吴兴，任农夫领兵前往吴郡，顾琛弃郡逃奔会稽。明帝因吴、吴兴、义兴、晋陵四郡已经平定，便留下吴喜统领沈怀明等将领向东攻打会稽，征召张永等向北攻打彭城，江方兴等向南攻打寻阳。
又任命吏部尚书蔡兴宗为左仆射，侍中褚渊为吏部尚书。
二月初九，吴喜抵达钱唐，孔璪、王昙生逃奔浙东。吴喜派遣强弩将军任农夫等领兵前往黄山浦；东部叛军沿河岸扎寨，任农夫等击败叛军。吴喜从柳浦渡江，攻取西陵，击杀庾业。会稽人对此极为恐惧，将士大多逃亡，孔觊已经无法控制局势了。二月二十日，上虞县令王晏起兵攻打会稽郡城，孔觊逃奔嵴山；车骑从事中郎张绥封存府库等待吴喜。二月二十一日，王晏进入郡城，杀死张绥，在偏殿抓获寻阳王刘子房。紧接着，放纵士兵大肆抢掠，府库被洗劫一空；擒获孔璪，并将其斩首。二月二十二日，嵴山百姓捆绑着孔觊送给王晏，王晏对他说：“这事是孔璪干的，与你无关，你可以写一份自首状，我会为你向皇上申诉。”孔觊说：“江东的谋划部署，没有一件不是我做主的；把罪责推给别人以求活命，这是你们这类人的做法罢了。”王晏于是将他斩首。顾琛、王昙生、袁标等人前往吴喜处请罪，吴喜都宽恕了他们。东部叛军的主将共有七十六人，在战场上斩杀十七人，其余的全部赦免。
薛索儿攻打申阐，久攻不下；派申令孙进入睢陵劝说申阐，申阐出城投降，薛索儿随后下令让申令孙杀死申阐。
山阳王刘休佑驻扎在历阳，辅国将军刘勔进军小岘。殷琰任命的南汝阴太守裴季之献出合肥投降朝廷。
邓琬性情鄙陋昏庸、贪婪吝啬，掌握大权后，父子二人卖官鬻爵，还派婢女仆役到集市上贩卖物品；日夜沉迷于饮酒高歌、下棋赌博，毫无节制；还自视甚高，有宾客登门拜访，往往十几天都见不到他；内部事务全部委托给褚灵嗣等三人，一群小人横行霸道，争相作威作福。于是官吏百姓怨声载道，朝廷内外人心离散。
邓琬派遣孙冲之率领龙骧将军薛常宝、陈绍宗、焦度等一万兵力作为前锋，占据赭圻。孙冲之在途中给晋安王刘子勋写信说：“船只已经备好，粮草武器也已整顿完毕，三军将士斗志昂扬，人人争相效命；正准备沿江东下，直取白下。希望迅速派遣陶亮等大军日夜兼程前来接应，分兵占据新亭、南州，那么一声令下就能平定京都。”刘子勋加封孙冲之为左卫将军；任命陶亮为右卫将军，统领郢、荆、湘、梁、雍五州兵力共计二万人，一同东下。陶亮本无才干谋略，得知建安王刘休仁率军北上，殷孝祖又已赶到，因此不敢前进，驻军于鹊洲。
殷孝祖自恃忠诚节气，便轻视侮辱各位将领，朝廷军队中凡是父子兄弟在南方叛军辖区的，殷孝祖全都想追究治罪。因此人心背离，没人愿意为他效力。宁朔将军沈攸之，对内安抚将士，对外协调各位将领，众人都依赖他。殷孝祖每次作战，常常让仪仗队跟随在身边，军中将士相互议论说：“殷统军可以说是找死的将领啊！如今与叛军交战，却用仪仗队标榜自己，要是有十个擅长射箭的人一起射击他，想不死都难！”三月初三，各路军队水陆并进，攻打赭圻；陶亮等领兵救援，殷孝祖在战场上被流箭射中，战死。军主范潜率领五百人向陶亮投降。人心极为震骇，众人都认为沈攸之应当接替殷孝祖担任主帅。
当时建安王刘休仁驻扎在虎槛，派遣宁朔将军江方兴、龙骧将军襄阳人刘灵遗各自率领三千人赶赴赭圻。沈攸之认为殷孝祖已死，陶亮等人有乘胜进攻的心思，第二天如果不再发起进攻，就会向叛军示弱。江方兴与自己职位相当，必定不会屈居自己之下；军政不统一，是导致失败的原因。于是率领各位军主前往江方兴处说：“如今四方都在反叛，国家所保住的，不过百里之地。只有殷孝祖被朝廷托付重任，可刚一交战，就兵败身亡，文武官员士气低落，朝野上下人心惶惶。事情能否成功，就看明天这一战了；如果作战失利，那么国家大事就无可挽回了。明天的战事，众人有的认为应当由我统领，我自忖懦弱浅薄，才干谋略不如你。现在就推举你为主帅，我们只应当同心协力作战罢了。”江方兴听后十分高兴，便答应了他。沈攸之出来后，各位军主都责怪他，沈攸之说：“我本来是为了救国保家，哪里计较职位的升降！况且我能屈居他之下，他必定不能屈居我之下。共同渡过难关，怎么能计较彼此的异同呢！”孙冲之对陶亮说：“殷孝祖是一员猛将，一战就被杀死，天下大事已经定了，不必再交战，应当直接攻取京都。”陶亮没有听从。
三月初四，江方兴率领各路军队进军交战，建安王刘休仁又派遣军主郭季之、步兵校尉杜幼文、屯骑校尉垣恭祖、龙骧将军京兆人段佛荣等三万人前往会合作战，从寅时到午时，大败叛军，追击到姥山后返回。杜幼文是杜骥的儿子。
孙冲之在湖口、白口修筑两座城池，军主竟陵人张兴世攻下了这两座城。
三月初五，明帝下诏任命沈攸之为辅国将军、假节，接替殷孝祖都督前锋诸军事。
陶亮得知湖口、白口两座城池失守，大为恐惧，急忙召孙冲之返回鹊尾，留下薛常宝等人驻守赭圻；原先在姥山及各山冈设置的营寨，也全部撤回，合力据守浓湖。
当时战事大规模兴起，国家财政不足，朝廷招募百姓捐献钱财粮食，赏赐给他们荒芜的县、郡，或者授予五品至三品不等的散官爵位。
军中粮食短缺，建安王刘休仁安抚慰问将士，平均分配粮食物资，哀悼死者、慰问伤员，亲自抚恤阵亡将士家属；因此十万大军，没有一人离心离德。
邓琬派遣豫州刺史刘胡率领三万人、铁甲骑兵二千人，向东驻扎在鹊尾，加上原有兵力共计十余万人。刘胡是老将，勇猛强健且富有谋略，屡立战功，将士们都畏惧他。司徒中兵参军冠军人蔡那，子弟留在襄阳，刘胡每次作战，都把他们悬挂在城外；蔡那照样奋勇作战，毫不顾及。吴喜平定三吴地区后，率领所部五千人，连同运输的物资粮草，抵达赭圻。
薛索儿率领一万多步兵骑兵从睢陵渡过淮河，进逼青、冀二州刺史张永的军营。三月初九，明帝下诏任命南徐州刺史桂阳王刘休范统领北讨诸军事，进军占据广陵；又下诏令萧道成领兵救援张永。
三月十一日，寻阳王刘子房被押送到建康，皇上宽恕了他，将其爵位贬为松滋侯。
三月十三日，北魏任命陕西王源贺为太尉。
明帝派遣宁朔将军刘怀珍率领龙骧将军王敬则等五千步兵骑兵，协助刘勔讨伐寿阳，斩杀庐江太守刘道蔚。刘怀珍是刘善明的侄子。
中书舍人戴明宝向皇上启奏，派遣军主竟陵人黄回招募士兵，击杀了寻阳政权任命的马头太守王广元。
前奉朝请、寿阳人郑黑，在淮河上游起兵响应建康朝廷，向东抵御殷琰，向西抗拒常珍奇；三月十八日，任命郑黑为司州刺史。
这时，殷琰的部将刘顺、柳伦、皇甫道烈、庞天生等人率领八千步兵骑兵向东占据宛唐；刘勔率领各路军队一同进军，在距离刘顺几里的地方扎营。当时殷琰派遣的各路军队，都受刘顺调度，但因皇甫道烈是当地豪强，柳伦是朝廷派来的人，刘顺出身低微，所以唯独不让他指挥这两支军队。刘勔刚到，营寨壕沟还没修筑好；刘顺想趁机进攻，皇甫道烈、柳伦不同意，刘顺无法单独进军，只好作罢。刘勔的营寨建成后，已无法强攻，双方于是陷入相持对峙。
三月二十五日，朝廷禁止使用新铸的钱币，只准使用古钱。
此时，沈攸之率领各路军队围攻赭圻。薛常宝等人粮食耗尽，向刘胡求救；刘胡用布袋装米，系在木筏和船腹上，假装船翻了，让米顺着水流漂向下游，以此供应赭圻守军。沈攸之怀疑其中有诈，便派人打捞船只和木筏，缴获了大量袋装大米。三月二十九日，刘胡率领一万步兵，连夜劈山开路，用布袋运米前往赭圻送粮。黎明时分，抵达城下，还隔着一条小壕沟，无法进城。沈攸之率领各路军队进行截击，双方展开殊死搏斗，刘胡的军队大败，丢弃粮食铠甲，沿山逃走，被斩杀和俘虏的人很多。刘胡本人也受伤了，勉强才逃回营寨。薛常宝等人对此十分惶恐，到了夏季四月初四，他们打开城门突围，逃回刘胡军中。沈攸之攻克赭圻城，斩杀宁朔将军沈怀宝等人，接纳投降士兵几千人。陈绍宗独自乘船逃往鹊尾。建安王刘休仁从虎槛进军驻扎在赭圻。
此时，刘胡等人的兵力仍然强盛。明帝想安抚人心，便派遣吏部尚书褚渊前往虎槛，选拔任用将士。当时因军功被授予官职的人很多，木板官印供应不足，开始使用黄纸书写任命状。
邓琬以晋安王刘子勋的名义，征召袁顗南下寻阳，袁顗率领雍州的全部兵力日夜兼程东下。邓琬任命黄门侍郎刘道宪代理荆州事务，侍中孔道存代理雍州事务。上庸太守柳世隆乘虚袭击襄阳，但没有攻克。柳世隆是柳元景弟弟的儿子。
散骑侍郎明僧暠担任青州刺史。平原、乐安二郡太守王玄默占据琅邪，清河、广川二郡太守王玄邈占据盘阳城，高阳、勃海二郡太守刘乘民占据临济城，都起兵响应建康朝廷。王玄邈是王玄谟的堂弟；刘乘民是刘弥之的侄子。沈文秀派遣军主解彦士攻打北海，攻克城池，杀死刘弥之。刘乘民的堂弟刘伯宗，召集乡邻，重新夺回北海，随后领兵向青州治所东阳城进军。沈文秀出兵抵抗，刘伯宗战死。明僧暠、王玄默、王玄邈、刘乘民联合兵力攻打东阳城，每次交战都被沈文秀击败，溃散后又重新集结，这样反复了十多次，最终没能攻克。
此时，杜叔宝认为朝廷军队驻守历阳，不能迅速前进；等到刘勔等人率军抵达，寿阳上下震动恐慌。刘顺等人出发时，只带了一个月的粮食，与刘勔相持日久，粮食耗尽。杜叔宝出动一千五百辆车，装满大米送给刘顺，并亲自率领五千精兵护送。吕安国得知后，对刘勔说：“刘顺有八千精锐士兵，而我们的兵力还不到他的一半。双方相持已久，强弱悬殊，如果再拖延下去，我们就无法立足了。我们所依赖的，是他们的粮食即将耗尽，而我们的粮食还有剩余。如果让杜叔宝的米运到，不仅难以再图谋击败他们，我们也无法持久坚守。如今只有从小路袭击他们的运米车队，出其不意，如果能制服他们，刘顺的军队就会不战而逃。”刘勔认为他说得对，于是用疲弱的士兵留守营寨，挑选一千名精兵配给吕安国和龙骧将军黄回，让他们从小路绕到刘顺后方，在横塘截击运米车队。
吕安国出发时，带了两天的熟食；等到食物吃完了，杜叔宝还没到，将士们便想返回，吕安国说：“你们早上已经吃了一顿饭。今晚运米车队一定会到；如果不到，夜里再回去也不晚。”到了夜晚，杜叔宝果然赶到了，把运米车排列成箱形阵，自己率领士兵在阵外游动警戒。幢主杨促怀率领五百人在前面开路，吕安国、黄回等人袭击斩杀了他，把他的士兵全部消灭。等到杜叔宝赶到后，黄回想乘胜进攻，吕安国说：“他会自己逃走的，不必再攻打他了。”于是率军后退三十里，扎营过夜。夜里派遣骑兵侦察，杜叔宝果然丢弃运米车队逃走了。吕安国又连夜前去烧毁运米车，驱赶着两千多头牛返回。
五月初一，夜里，刘顺的军队溃散，刘顺逃往淮西投奔常珍奇。于是刘勔擂鼓进军，向寿阳进发。杜叔宝收拢百姓和逃散的士兵，环城固守；刘勔与各路军队在城外分别扎营。
山阳王刘休佑给殷琰写信，向他陈述利害得失，明帝又派遣御史王道隆携带诏书前往寿阳，赦免殷琰的罪责。刘勔也给殷琰写信，并把殷琰哥哥殷瑗的儿子殷邈的信一起送去。殷琰与杜叔宝等人都有投降的意愿，但众人意见不一，于是又环城固守。
弋阳西山蛮族首领田益之起兵响应建康朝廷，明帝下诏任命田益之为辅国将军，都督弋阳西山事务。五月初六，任命辅国将军沈攸之为雍州刺史。五月二十一日，任命尚书左仆射王景文为中军将军。五月二十四日，任命宁朔将军刘乘民为冀州刺史。
五月二十八日，将昭太后安葬在修宁陵。
此时，张永、萧道成等人与薛索儿交战，大败薛索儿，薛索儿退保石梁；粮食耗尽后军队溃散，逃向乐平，被申令孙的儿子申孝叔斩杀。薛安都的儿子薛道智逃到合肥，向裴季之投降。傅灵越逃到淮西，被武卫将军沛郡人王广之活捉，押送到刘勔那里。刘勔责问他反叛的罪行，傅灵越说：“九州都起来反抗，难道唯独我一个人吗！薛公不能专任有智有勇的人，反而托付给子侄，这是他失败的原因。人生终究一死，我实在没有脸面乞求活命。”傅灵越被押送到建康，明帝想赦免他，傅灵越始终不改供词，于是将他处死。
邓琬因刘胡与沈攸之等人相持不下，久战不决，于是加授袁顗都督征讨诸军事。六月十八日，袁顗率领一千艘楼船，两万士兵，进入鹊尾。袁顗本来就没有将领的谋略，性情又怯懦，在军中从不穿军装，谈话也不涉及战阵之事，只知赋诗谈论义理，不再安抚接见各位将领；刘胡每次商议军事，袁顗的回应都很简略。由此大失人心，刘胡常常咬牙切齿，心怀怨恨。刘胡因南方的粮食还没运到，士兵缺乏粮草，就向袁顗借襄阳的物资，袁顗不同意，还说：“京都的两处宅院还没建成，正需要料理。”又听信往来之人的传言，说“建康米价昂贵，一斗达到几百钱”，认为朝廷军队会不攻自溃，于是手握重兵等待时机。
田益之率领一万多蛮族士兵围攻义阳，邓琬派遣司州刺史庞孟虬率领五千精兵救援，田益之不战而溃。
安成太守刘袭、始安内史王识之、建安内史赵道生，都献出本郡投降朝廷。刘袭是刘道怜的孙子。
这时，萧道成的长子萧赜担任南康赣县令，邓琬派遣使者将他逮捕关押。萧赜的门客兰陵人桓康挑着萧赜的妻子裴氏和儿子萧长懋、萧子良逃到山中，与萧赜的族人萧欣祖等人结交宾客一百多人，攻打南康郡城，攻破监狱救出萧赜。南康相沈肃之率领将士追赶萧赜，萧赜与他交战，将他擒获。萧赜自称宁朔将军，占据郡城起兵，与刘袭等人相互呼应。邓琬任命中护军殷孚为豫章太守，都督上游五郡，以防备刘袭等人。
衡阳内史王应之起兵响应建康，在长沙袭击湘州行事何慧文。王应之与何慧文放下兵器近身搏斗，王应之砍伤何慧文八处，何慧文斩断王应之的脚，将他杀死。
始兴人刘嗣祖等人占据郡城起兵响应建康，广州刺史袁昙远派遣将领李万周等人讨伐。刘嗣祖欺骗李万周说“寻阳已经平定”，李万周返回袭击番禺，擒获袁昙远，将他斩首。皇上任命李万周代理广州事务。
起初，武都王杨元和治理白水，势力微弱无法自立，于是放弃封国投奔北魏。杨元和的堂弟杨僧嗣重新自立，驻扎在葭芦。费欣寿抵达巴东，巴东人任叔儿占据白帝城，自称辅国将军，攻打费欣寿，将他斩杀，任叔儿于是据守三峡。萧惠开又派遣治中程法度率领三千士兵出兵梁州，杨僧嗣率领氐族各部截断他的去路，并秘密派遣使者向朝廷报告。秋季七月十二日，朝廷任命杨僧嗣为北秦州刺史、武都王。
此时，各路军队与袁顗在浓湖相持，久战不决。龙骧将军张兴世建议说：“叛军占据上游，兵力强盛，地势优越。我们虽然能够坚守，却难以制服他们。如果派遣几千奇兵暗中绕到他们上游，凭借险要地势扎营，见机行事，让他们首尾难以兼顾，进退犹豫不决，中流被截断后，粮草运输自然困难，这是制服叛军的奇计。钱溪江岸最狭窄，距离大军不远，下游有洄流，船只下行必定会在此停泊，又有横浦可以隐藏船只，一千人守卫险要之地，一万人也无法通过。这是最关键的战略要地。”沈攸之、吴喜都赞同他的计策。恰逢庞孟虬领兵前来援助殷琰，刘勔派遣使者紧急求援，建安王刘休仁想派遣张兴世前去救援。沈攸之说：“庞孟虬的军队不过是乌合之众，必定成不了大事，派遣别的将领率领几千步兵骑兵，就足以制服他。张兴世这次行动，是关系安危的关键，绝不能停止。”于是派遣段佛荣领兵救援刘勔，同时挑选七千名战士、二百艘轻便战船配给张兴世。
张兴世率领军队逆流而上，不久又退回来，这样反复了好几天。刘胡得知后，笑着说：“我尚且不敢越过他们南下夺取扬州，张兴世是什么人，竟敢轻率地想占据我的上游！”于是没有防备。一天夜里四更时分，恰逢顺风，张兴世下令扬帆直进，渡过湖口、白口，经过鹊尾。刘胡察觉后，才派遣将领胡灵秀领兵在东岸侧翼跟随前进。七月十三日傍晚，张兴世驻扎在景洪浦，胡灵秀也在此停留。张兴世暗中派遣将领黄道标率领七十艘战船径直奔赴钱溪，修筑营寨；七月十四日，张兴世领兵进占钱溪，胡灵秀无法阻止。七月十五日，刘胡亲自率领二十六支水军和步兵前来攻打钱溪。将士们想迎击固守，张兴世阻止说：“叛军还很远，士气旺盛，箭矢密集；密集的箭矢容易耗尽，旺盛的士气也容易衰落，不如等待他们。”下令将士们像往常一样修筑城池。不久刘胡的军队逼近，船只进入洄流；张兴世命令寿寂之、任农夫率领几百名壮士发起攻击，各路军队相继跟进，刘胡的军队大败而逃，被斩首几百人，刘胡收拢军队退下。当时张兴世的营寨还没加固，建安王刘休仁担心袁顗会合力再次攻打钱溪，想分散他们的兵力。七月十六日，下令沈攸之、吴喜等人用蒙皮战船进攻浓湖，斩杀和俘虏一千多人。当天，刘胡率领两万步兵、一千铁甲骑兵，想再次攻打张兴世。还没到钱溪几十里，袁顗因浓湖危急，急忙派人追回刘胡，钱溪的营寨因此得以建成。刘胡派人散布谣言“钱溪已经平定”，朝廷军队都很害怕，沈攸之说：“不对。如果钱溪真的战败，一万人中应该有一个人逃回来报告；这必定是他们作战失利，故意散布谣言来迷惑我们。”于是下令军中不得妄动；不久钱溪的捷报就传到了。沈攸之把钱溪送来的刘胡军队的耳鼻展示给浓湖的叛军看，袁顗看到后十分惊骇恐惧。沈攸之傍晚时分领兵返回。
龙骧将军刘道符攻打山阳，程天祚请求投降。
庞孟虬进军到弋阳，刘勔派遣吕安国等人在蓼潭迎击，大败庞孟虬，庞孟虬逃往义阳。王玄谟的儿子王昙善起兵占据义阳响应建康，庞孟虬逃到蛮族地区死去。
刘胡派遣辅国将军薛道标袭击合肥，杀死汝阴太守裴季之，刘勔派遣辅国将军垣闳反击。垣闳是垣阆的弟弟；薛道标是薛安都的儿子。
淮西人郑叔举兵攻打常珍奇，以响应郑黑；七月二十四日，朝廷任命郑叔举为北豫州刺史。崔道固遭到当地百姓攻打，关闭城门固守。明帝派遣使者安抚慰问，崔道固请求投降。七月二十七日，朝廷重新任命崔道固为徐州刺史。这时，皇甫道烈等人得知庞孟虬兵败身亡，便一同打开城门出城投降。
张兴世占据钱溪后，浓湖的叛军缺乏粮食。邓琬大规模运送物资粮草，因畏惧张兴世，所以不敢前进。刘胡率领四百艘轻便战船，从鹊头内侧航道想要攻打钱溪，不久对长史王念叔说：“我从小习惯步兵作战，不熟悉水战。步兵作战时，我常常在数万人之中；水战却在一艘战船之上，每艘船各自前进，不再相互配合，我身边只有三十人，这不是万全之策，我不做这样的事。”于是借口身患疟疾，停留在鹊头不再前进，派遣龙骧将军陈庆率领三百艘战船前往钱溪，告诫陈庆：“不必交战。张兴世是我熟悉的人，他自然会逃走。”陈庆抵达钱溪，驻扎在梅根。
刘胡派遣别将王起率领一百艘战船攻打张兴世，张兴世迎击王起，大败叛军。刘胡率领剩余的战船疾驰返回，对袁顗说：“张兴世的营寨已经建成，不能仓促攻打；昨天的小规模交战，不足以造成损失。陈庆已经与南陵、大雷各路军队一同阻断了他的上游，大军驻扎在这里，鹊头的各位将领又截断了他的下游；他已经陷入包围之中，不必再担忧。”袁顗恼怒刘胡不作战，对他说：“粮草运输被阻断，该怎么办？”刘胡说：“他尚且能逆流越过我军向上游进军，我们的粮草为什么不能顺流越过他向下游运送呢！”于是派遣安北府司马沈仲玉率领一千人徒步前往南陵迎接粮草。
沈仲玉抵达南陵，装载了三十万斛大米，几十船钱财布匹，竖起木栅作为营垒，打算强行通过钱溪。行进到贵口，不敢继续前进，派遣密使报告刘胡，让他派遣重兵前来接应。张兴世派遣寿寂之、任农夫等人率领三千人赶到贵口袭击沈仲玉，沈仲玉逃回袁顗的营寨，物资全部被缴获；刘胡的军队极为惊骇恐惧，将领张喜前来投降。
镇东中兵参军刘亮进军逼近刘胡的营寨，刘胡无法控制局势。袁顗恐惧地说：“叛军已经攻入心腹之地，我们怎么能活下去！”刘胡暗中谋划逃走，八月二十四日，欺骗袁顗说：“我想再率领两万步兵骑兵，北上攻取钱溪，同时接运大雷剩余的粮草。”让袁顗挑选全部马匹配给他。当天，刘胡丢下袁顗离去，径直前往梅根。先命令薛常宝准备船只，调动南陵的各路军队，烧毁大雷的各座城池后逃走。到了夜里，袁顗才得知此事，大怒，骂道：“今年被这小子耽误了！”叫来自己平时乘坐的好马“飞燕”，对部下说：“我要亲自去追击他！”于是也逃走了。
八月二十五日，建安王刘休仁领兵进入袁顗的营寨，接纳十万投降士兵，派遣沈攸之等人追击袁顗。袁顗逃到鹊头，与戍主薛伯珍以及所率领的几千人一同离去，打算前往寻阳。夜里，停留在山间，杀马犒劳将士，回头对薛伯珍说：“我不是不能死；只是想亲自到寻阳，向主上谢罪，然后再自刎。”于是激昂地呵斥身边的人索要符节，再也没有人回应。到了黎明，薛伯珍请求屏退旁人议事，随即斩杀袁顗的首级，前往钱溪投奔马军主襄阳人俞湛之。俞湛之于是斩杀薛伯珍，将两人的首级一同送去，作为自己的功劳。
刘胡率领两万人前往寻阳，欺骗晋安王刘子勋说：“袁顗已经投降，军队都溃散了，只有我率领部下独自返回；应当迅速部署，准备一战的物资。我会驻守湓城，誓死不背叛。”于是在长江外侧连夜赶往沔口。
邓琬得知刘胡逃走，忧愁惶恐无计可施，急忙召集中书舍人褚灵嗣等人商议，众人都不知该怎么办。张悦谎称生病，召集邓琬商议事务，命令手下在帐后埋伏武士，告诫他们：“如果听到我喊拿酒，就出来动手。”邓琬到达后，张悦说：“你最先发起这个谋反计划，如今事情危急，有什么计策？”邓琬说：“只能斩杀晋安王，封存府库，以此向朝廷谢罪。”张悦说：“难道可以出卖殿下以求活命吗！”随即喊拿酒。张悦的儿子张洵持刀冲出，斩杀邓琬。中书舍人潘欣之得知邓琬死去，赶忙领兵赶来。张悦派人对他说：“邓琬谋反，如今已经被斩首。”潘欣之才撤兵返回。接着，张悦逮捕邓琬的儿子，一并杀死。随后张悦独自乘船带着邓琬的首级疾驰东下，前往建安王刘休仁处投降。
这时，寻阳陷入混乱。蔡那的儿子蔡道渊在寻阳被关押在作坊里，挣脱枷锁进入城中，抓获刘子勋，将他囚禁起来。沈攸之等各路军队抵达寻阳，斩杀晋安王刘子勋，将首级传送到建康，刘子勋当时十一岁。
起初，邓琬派遣临川内史张淹从鄱阳山路进入三吴地区，驻扎在上饶，得知刘胡战败，军副鄱阳太守费晔斩杀张淹投降。张淹是张畅的儿子。
废帝在位时，士大夫们畏惧灾祸，都想远离京城。到这时，那些流亡在外遭遇战乱的人，一百个中没有一个存活，众人这才佩服蔡兴宗的先见之明。
九月初八，朝廷任命山阳王刘休佑为荆州刺史。
九月初九，朝廷解除戒严，实行大赦。
九月十六日，司徒刘休仁抵达寻阳，派遣吴喜、张兴世前往荆州，沈怀明前往郢州，刘亮及宁朔将军南阳人张敬儿前往雍州，孙超之前往湘州，沈思仁、任农夫前往豫章，平定剩余的叛军。
刘胡逃到石城，被抓获后斩首。郢州行事张沈乔装成僧人，暗中逃走，被追兵抓获杀死。荆州行事刘道宪得知浓湖平定，便遣散士兵，派遣使者向朝廷请罪。荆州治中宗景等人领兵入城，杀死刘道宪，抓获临海王刘子顼投降。孔道存得知寻阳已经平定，便派遣使者请求投降；不久听说柳世隆、刘亮即将到来，部众全部逃散，孔道存和三个儿子都自杀身亡。皇上认为何慧文兼具文武才能，派吴喜宣布圣旨赦免他。何慧文说：“我既已背叛朝廷，亲手杀害忠义之人，还有什么脸面见天下士人！”于是自杀。安陆王刘子绥、临海王刘子顼、邵陵王刘子元都被赐死，刘顺及留在荆州的残余党羽全部被处死。朝廷下诏追赠各位为守节而死的大臣，对有功之人分别给予不同的封赏。
九月二十五日，北魏开始设立郡学，设置博士、助教和生员，这是采纳了中书令高允、相州刺史李欣的建议。李欣是李崇的儿子。
明帝诛杀晋安王刘子勋等人后，对待世祖的其他儿子仍像往常一样。司徒刘休仁从寻阳返回，对明帝说：“松滋侯刘子房兄弟还在，将来会成为国家的隐患，应当尽早处置他们。”冬季十月初一，松滋侯刘子房、永嘉王刘子仁、始安王刘子真、淮南王刘子孟、南平王刘子产、庐陵王刘子舆、刘子趋、刘子期、东平王刘子嗣、刘子悦都被赐死，镇北咨议参军路休之、司徒从事中郎路茂之、兖州刺史刘祗、中书舍人严龙都因牵连被杀。世祖的二十八个儿子至此全部死去。刘祗是刘义欣的儿子。
这时，刘勔围攻寿阳，从初春到冬末，对内攻城、对外防御，每战必胜，凭借宽厚赢得将士的人心。寻阳平定后，皇上让中书省起草诏书晓谕殷琰，蔡兴宗说：“天下已经平定，这是殷琰反思过错的时候。陛下应当亲手写下几行诏书来安慰引导他。如今直接让中书省起草诏书，他必定怀疑不是真的，这不是迅速平定一方战乱的办法。”明帝没有听从。殷琰收到诏书，认为是刘勔伪造的，所以不敢投降。杜叔宝封锁寻阳战败的消息，有传播消息的人立即被杀，防守更加坚固。凡是有投降的人，明帝就把他们送到寿阳城下，让他们与城中人交谈，因此城中人心离散沮丧。
殷琰想向北魏投降，主簿谯郡人夏侯详劝说殷琰：“今天的举动，本来是为了效忠气节。如果国家有了正统君主，就应当归附朝廷，怎么能向北称臣、穿异族服装呢！况且如今魏军近在淮河岸边，官军还不确定我们的去向，如果派遣使者归顺朝廷，朝廷必定会隆重安抚接纳，岂止是免除罪责而已。”殷琰于是派夏侯详出城拜见刘勔，夏侯详劝说刘勔：“如今城中士民明知处境困窘却仍固守，是害怕将军诛杀，都想归附北魏。希望将军放宽刑罚、予以赦免，他们就会争相前来投降了。”刘勔答应了，让夏侯详到城下，呼喊城中人，传达刘勔的意思。十月初二，殷琰率领将领僚属反绑双手出城投降，刘勔对他们全部加以安抚，没有杀戮一人。进入城中后，刘勔约束将士，对士民的财物秋毫无犯，寿阳人大为喜悦。此时，魏军抵达师水，准备救援寿阳；得知殷琰已经投降，于是劫掠义阳几千人后离去。很久以后，殷琰又入朝为官，官至少府后去世。
这时，萧惠开在益州，大量施行刑罚诛杀，蜀人猜疑怨恨。得知费欣寿战败阵亡，程法度无法前进，于是晋原一郡反叛，其他各郡纷纷响应，合兵围攻成都。城中的北方士兵不过两千人，萧惠开将所有蜀人全部派出城，独自与北方士兵坚守。蜀人得知寻阳已经平定，争相想要屠城，部众达到十几万人。萧惠开每次派兵出战，没有不胜的。
这时，明帝派遣萧惠开的弟弟萧惠基从陆路出使成都，赦免萧惠开的罪责。萧惠基抵达涪城，蜀人阻拦扣留萧惠基，不让他前进。萧惠基率领部下攻击他们，斩杀首领，然后才得以继续前进。萧惠开奉圣旨投降，成都的包围得以解除。
明帝又派遣萧惠开的同宗萧宝首从水路前往益州慰劳。萧宝首想把平定蜀地作为自己的功劳，进一步鼓动蜀人，让他们攻打萧惠开。于是蜀地各处纷纷起兵，凡是离散的人一时间全部集结，与萧宝首一起进逼成都，部众号称二十万。萧惠开想攻击他们，将领僚属都说：“如今慰劳的使者到来却抵抗他，怎么向朝廷表明清白？”萧惠开说：“如今奏表书信的通道被阻断，不作战怎么能打通与京城的联系？”于是派遣宋宁太守萧惠训等人率领一万士兵迎战，大败叛军，生擒萧宝首，将他囚禁在成都，并派遣使者向朝廷说明情况。明帝派人将萧宝首押送到建康，召萧惠开返回建康。抵达后，明帝询问他起兵的情况。萧惠开说：“我只知道叛逆与顺从，不知道天命；况且不是我引发的战乱，也不是我平定的战乱。”明帝听后赦免了他。
这一年，朝廷侨置兖州，治所设在淮阴；徐州治所设在钟离；青、冀二州共设一名刺史，治所设在郁洲。郁洲在海中，周长几百里，用石头垒成城墙，高八九尺，虚设郡县，流亡的百姓没有多少。
张永、沈攸之进军逼近彭城，驻扎在下磕，分别派遣羽林监王穆之率领五千士兵在武原守卫粮草辎重。
北魏的尉元抵达彭城，薛安都出城迎接。尉元派遣李璨与薛安都先进入城中，接管城门钥匙；另外派遣孔伯恭率领两千精锐士兵安抚内外，然后才入城。当天夜里，张永攻打南门，没能攻克而撤退。
尉元对薛安都不加礼遇，薛安都后悔投降，又谋划反叛北魏；尉元察觉后，薛安都未能付诸实施。薛安都用重金贿赂尉元等人，把罪责推到女婿裴祖隆身上并杀死他。尉元让李璨与薛安都守卫彭城，自己领兵攻击张永，切断他的粮道，又在武原击败王穆之。王穆之率领剩余部众前往投奔张永，尉元进军攻打张永的军队。
南朝宋这一家子杀来杀去图了个啥？这不，宋明帝刚登上皇位，藩王又开始作乱了。到了公元466年春季，正月初一，己丑朔日，北魏实行大赦，并改年号为天安。
正月初五，朝廷征召会稽太守、寻阳王刘子房担任抚军将军，同时任命巴陵王刘休若接替他的职位。
正月初六，朝廷内外实行戒严。任命司徒、建安王刘休仁都督征讨诸军事，车骑将军、江州刺史王玄谟担任副职。刘休仁驻军于南州，任命沈攸之为寻阳太守，领兵驻扎在虎槛。当时王玄谟大军尚未出发，前锋共有十支军队，陆续抵达前线。各军每晚都自立暗号，互不统属、不相通报。沈攸之对众将领说：“如今各军暗号不同，若有农夫、渔夫夜间相互呵斥，就会导致军中惊骇混乱，这是招致失败的做法。请统一沿用一支军队的暗号。”众将全都听从了他的建议。
此时，邓琬大肆宣扬祥瑞征兆，谎称接到路太后的玺书，率领将领僚属向晋安王刘子勋奉上尊号。正月初七，刘子勋在寻阳登基称帝，改年号为义嘉。任命安陆王刘子绥为司徒、扬州刺史；寻阳王刘子房、临海王刘子顼一同加授开府仪同三司；任命邓琬为尚书右仆射，张悦为吏部尚书，袁顗加授尚书左仆射；其余将领僚属及各州郡官员，分别得到不同等级的任命和爵位晋升。
正月初八，朝廷任命征虏司马申令孙为徐州刺史。申令孙是申坦的儿子。在义阳设置司州，任命义阳内史庞孟虬为司州刺史。
徐州刺史薛安都、冀州刺史清河人崔道固都起兵响应寻阳的刘子勋。皇上向青州刺史沈文秀征兵，沈文秀派遣将领平原人刘弥之等人领兵赶赴建康。恰逢薛安都派遣使者邀请沈文秀，沈文秀便改令刘弥之等人响应薛安都。济阴太守申阐占据睢陵响应建康朝廷，薛安都派遣侄子、直阁将军薛索儿，太原太守、清河人傅灵越等人进攻睢陵。申阐是申令孙的弟弟。薛安都的女婿裴祖隆驻守下邳，刘弥之抵达下邳后，转而率领所部响应建康，袭击裴祖隆。裴祖隆兵败，与征北参军垣崇祖逃奔彭城。垣崇祖是垣护之的侄子。刘弥之的族人、北海太守刘怀恭，侄子刘善明都起兵响应刘弥之，薛索儿得知这个消息后，便放弃睢陵，领兵攻击刘弥之。刘弥之战败，逃奔北海据守。申令孙进占淮阳，向薛索儿请求投降。庞孟虬也拒不接受朝廷任命，起兵响应寻阳。
明帝征召寻阳王长史、代理会稽郡事务的孔觊担任太子詹事，任命平西司马庾业接替他的职位；又派遣都水使者孔璪前往东部慰劳。孔璪劝说孔觊：“建康兵力薄弱，不如据守会稽、吴郡、吴兴、义兴、晋陵五郡，响应袁顗、邓琬。”孔觊于是起兵，急传檄文拥戴寻阳的刘子勋。吴郡太守顾琛、吴兴太守王昙生、义兴太守刘延熙、晋陵太守袁标都占据本郡响应孔觊。明帝又任命庾业接替刘延熙担任义兴太守，庾业行至长塘湖，立即与刘延熙会合。
益州刺史萧惠开得知晋安王刘子勋起兵，便召集将领僚属说：“湘东王（刘彧）是太祖的嫡孙（昭为宗庙左列，指太祖后裔）；晋安王（刘子勋）是世祖的嫡孙（穆为宗庙右列，指世祖后裔），二人都有资格继承皇位。但景和帝（刘子业）虽然昏庸，本是世祖的子嗣；即便他不能胜任社稷之主，世祖的后裔还有很多。我蒙受世祖的恩宠，应当拥戴九江的晋安王。”于是派遣巴郡太守费欣寿率领五千人东下。此后，湘州行事何慧文、广州刺史袁昙远、梁州刺史柳元怙、山阳太守程天祚都归附了刘子勋。柳元怙是柳元景的堂兄。
这一年，各地的贡品和赋税都送往寻阳，朝廷所保住的，只有丹阳、淮南等几个郡，其中有些县还响应刘子勋。东部叛军已抵达永世，宫廷和朝廷都陷入恐慌。明帝召集大臣商议事情的成败。蔡兴宗说：“如今天下一同反叛，人人怀有异心。应当以镇静安抚局势，以最大的诚信对待他人。反叛者的亲戚遍布宫廷和朝廷，如果依法惩处他们，就会立即导致土崩瓦解，应当明确罪责不牵连他人的原则。民心安定之后，人们就会有作战的决心，朝廷禁军精锐勇猛，武器铠甲锋利，用来对付没有作战经验的叛军，形势相差悬殊。希望陛下不要忧虑。”明帝认为他说得对。
建武司马刘顺劝说豫州刺史殷琰响应寻阳，殷琰因家人在建康，没有同意。右卫将军柳光世从宫中逃出投奔彭城，路过寿阳时，声称建康必定守不住。殷琰相信了他的话，而且自己素来没有亲信部曲，又被当地豪强、前右军参军杜叔宝等人控制，不得已而顺从。殷琰任命杜叔宝为长史，内外军事都由杜叔宝专断。明帝对蔡兴宗说：“各处尚未平定，殷琰又反叛了；近日民心如何？事情能成功吗？”蔡兴宗说：“叛逆与忠顺，我无法分辨。如今商旅断绝，但粮食却十分充足且价格低廉，各地叛军云集，而民心反而更加安定。由此推断，平定叛乱是必然的。但我所担忧的，更在平定之后，就像羊祜所说：‘平定之后，才更要劳烦陛下思虑啊。’”明帝说：“确实如你所言。”明帝知道殷琰归附寻阳并非本意，于是更加优厚地安抚他的家人，以便招降他。
汝南、新蔡二郡太守周矜在悬瓠起兵响应建康。袁顗引诱周矜的司马、汝南人常珍奇活捉周矜，并将其斩首，任命常珍奇接替太守职位。
明帝派遣冗从仆射垣荣祖返回徐州劝说薛安都，薛安都说：“如今京都周围不足百里之地还在朝廷控制之下，且不说攻城取胜易如反掌，我也不想背叛孝武帝（刘子业之父，刘子勋祖父）。”垣荣祖说：“孝武帝的所作所为，足以招致祸殃，如今虽然天下人一同反叛，但这正是加速灭亡，不会有什么作为。”薛安都不听，反而留下垣荣祖让他担任将领。垣荣祖是垣崇祖的堂兄。
兖州刺史殷孝祖的外甥、司法参军颍川人葛僧韶，请求让殷孝祖入朝，明帝派遣他前往。当时薛索儿占据了交通要道，葛僧韶从小路得以抵达，劝说殷孝祖：“景和帝凶残暴虐，是开天辟地以来所未有之；朝野上下危在旦夕，性命仅存片刻。主上（刘彧）平定凶暴，再造天地，国家混乱、朝廷危难之时，应当拥立年长的君主。而一群糊涂人相互煽动，无端制造事端，贪图拥立幼主的利益，争相抱有非分之想。如果天道帮助叛逆，群凶得逞，那么主上年幼、时局艰难，权力不统一，战乱将接连发生，哪里还有我们的容身之地！舅舅年轻时就有立功的志向，若能率领兖州的精锐之师，返回拥戴朝廷，不仅能辅佐君主、平定叛乱，还能名垂青史。”殷孝祖详细询问了朝廷的消息，葛僧韶随机应变地回答和开导，并陈述朝廷军队精锐强盛，主上打算委任他为前锋主将。殷孝祖当天就把妻子儿女托付在瑕丘，率领文武官员二千人，跟随葛僧韶返回建康。当时各地都归附了寻阳，朝廷只保住了丹阳一郡；而永世县令孔景宣又反叛，义兴叛军即将抵达延陵，朝廷内外忧虑危急，众人都想逃散。殷孝祖突然到来，兵力不少，且都是北方和楚地的壮士，人心大为安定。正月十六日，朝廷晋升殷孝祖为抚军将军，假节、督前锋诸军事，派遣他前往虎槛，赏赐十分丰厚。
起初，明帝派遣东平人毕众敬前往兖州招募兵士，毕众敬抵达彭城后，薛安都用利害关系劝说他，伪造皇上的命令让毕众敬代理兖州事务，毕众敬听从了他。殷孝祖派司马刘文石驻守瑕丘，毕众敬领兵袭击并杀死了刘文石。薛安都素来与殷孝祖有矛盾，便让毕众敬杀害了殷孝祖的几个儿子。兖州境内都归附了薛安都，只有东平太守申纂占据无盐，拒不从命。申纂是申钟的曾孙。
正月十八日，明帝亲自统领军队，出宫驻扎在中堂。正月二十三日，任命山阳王刘休佑为豫州刺史，督辅国将军彭城人刘勔、宁朔将军广陵人吕安国等各路军队向西讨伐殷琰。巴陵王刘休若督建威将军吴兴人沈怀明、尚书张永、辅国将军萧道成等各路军队向东讨伐孔觊。当时将士大多是东部地区的人，父兄子弟都已归附孔觊。明帝于是在送军出征时，向众人宣告：“朕正致力于以德治国、减轻刑罚，使父子兄弟罪责互不牵连，归顺朝廷或依附叛逆，一律以本人的选择为判断标准。你们应当深刻理解朕的心意，不要为亲戚的安危担忧。”众人于是大为喜悦。凡是反叛者在京城的亲戚党羽，都让他们像往常一样担任官职。
正月二十四日，路太后去世。
孔觊派遣他的孙子孔昙瓘等人驻军于晋陵九里，军阵十分盛大。沈怀明抵达奔牛，所率领的兵力薄弱，于是修筑营垒固守。张永抵达曲阿，不知道沈怀明是否安全；百姓惊慌骚乱，张永退回到延陵，靠近巴陵王刘休若，众将领都劝说刘休若退保破冈。当天，天气极为寒冷，风雪猛烈，堤坝决口损坏，士兵们没有固守的决心。刘休若宣告命令：“敢说撤退的人斩首！”军心才稍稍安定，于是修筑营垒休整军队。不久便收到沈怀明的书信，得知叛军尚未推进，军主刘亮又率军赶到，兵力逐渐强盛，人心才安定下来。刘亮是刘怀慎的曾孙。
殿中御史吴喜曾以主书的身份侍奉世祖（刘骏），逐渐升迁至河东太守。到这时，他请求率领三百名精兵，前往东部拼死作战。明帝任命吴喜为建武将军，挑选羽林军中的勇士配属给他。议论的人认为“吴喜是掌管文书的官吏，从未担任过将领，不可派遣。”中书舍人巢尚之说：“吴喜过去跟随沈庆之，多次经历军旅之事，性情既勇猛果断，又熟悉战阵；如果能任用他，必定会有成效。众人对此议论纷纷，都是不能识别人才罢了。”于是派遣吴喜出征。吴喜先前多次奉命出使东吴，性情宽厚，所到之处的百姓都感念他。百姓听说吴河东（吴喜）前来，都望风而降或四散逃离，因此吴喜所到之处都能取胜。
永世县人徐崇之攻打孔景宣，将其斩首，吴喜任命徐崇之代理永世县事务。吴喜抵达国山，遭遇东部叛军，便立即发起攻击，大败叛军。从国山进军驻扎在吴城，刘延熙派遣将领杨玄等人抵御。吴喜兵力十分薄弱，而杨玄等人兵力强盛。吴喜奋力出击，斩杀杨玄，进逼义兴。刘延熙构筑栅栏截断长桥，据守郡城自保，吴喜修筑营垒与他对峙。
庾业在长塘湖口两岸修筑城池，拥有七千兵力，与刘延熙遥相呼应。沈怀明、张永与晋陵的叛军相持不下，久战不决。外监朱幼举荐司徒参军督护任农夫勇猛果敢有胆识，明帝配给他四百人，让他协助东部讨伐叛军。任农夫从延陵出发前往长塘，疾驰进攻庾业的城池，奋力作战，大败庾业，庾业弃城逃奔义兴。任农夫收缴了他的船只和武器，向义兴进军，援助吴喜。二月初一，己未朔日，吴喜渡过河水攻打义兴郡城，分兵攻击各个营垒，他亲自登上高处指挥，仿佛下令四面同时进攻。义兴城中百姓大为恐惧，各营垒都溃散了。刘延熙投水而死，于是攻克义兴。
北魏丞相、太原王乙浑独揽朝政大权，诛杀了许多官员。安远将军贾秀掌管吏部事务，乙浑多次对贾秀说，要为自己的妻子请求公主封号，贾秀回答：“公主岂是普通姓氏之人配称的！我贾秀宁愿今日去死，也不愿让后世取笑！”乙浑大怒，骂道：“老奴才做官，太吝啬了！”恰逢侍中拓跋丕告发乙浑谋反，二月初二，冯太后抓捕乙浑，将其诛杀。贾秀是贾彝的儿子；拓跋丕是烈帝拓跋翳槐的玄孙。接着，冯太后临朝听政，任命中书令高允、中书侍郎渔阳人高闾以及贾秀一同参与朝政决策。
这时，沈怀明、张永、萧道成等率军驻扎在九里以西，与东部叛军相持。东部叛军得知义兴兵败，全都震惊恐慌。皇上派遣积射将军济阳人江方兴、御史王道隆前往晋陵视察东部军情。孔觊的部将孙昙瓘、程扞宗等人修筑了五座城池，相互连接呼应。程扞宗的城池还未加固，王道隆与各位将领商议说：“程扞宗的城池尚未建成，正好可以乘机攻取，上能不负皇上旨意，下能鼓舞军心士气。”二月初三，王道隆率领所部紧急进攻，攻克城池，斩杀程扞宗。张永等人乘胜进击孙昙瓘等，二月初四，孙昙瓘等兵败，与袁标一同弃城逃走，于是攻克晋陵。
吴喜率军抵达义乡。孔璪驻扎在吴兴南亭，太守王昙生前往孔璪处商议事务；得知朝廷军队已经逼近，孔璪大为恐惧，从床上摔下来，说：“朝廷悬赏捉拿的人，只有我而已；如今不赶紧逃走，就要被人擒获了！”于是与王昙生逃奔钱唐。吴喜进入吴兴，任农夫领兵前往吴郡，顾琛弃郡逃奔会稽。明帝因吴、吴兴、义兴、晋陵四郡已经平定，便留下吴喜统领沈怀明等将领向东攻打会稽，征召张永等向北攻打彭城，江方兴等向南攻打寻阳。
又任命吏部尚书蔡兴宗为左仆射，侍中褚渊为吏部尚书。
二月初九，吴喜抵达钱唐，孔璪、王昙生逃奔浙东。吴喜派遣强弩将军任农夫等领兵前往黄山浦；东部叛军沿河岸扎寨，任农夫等击败叛军。吴喜从柳浦渡江，攻取西陵，击杀庾业。会稽人对此极为恐惧，将士大多逃亡，孔觊已经无法控制局势了。二月二十日，上虞县令王晏起兵攻打会稽郡城，孔觊逃奔嵴山；车骑从事中郎张绥封存府库等待吴喜。二月二十一日，王晏进入郡城，杀死张绥，在偏殿抓获寻阳王刘子房。紧接着，放纵士兵大肆抢掠，府库被洗劫一空；擒获孔璪，并将其斩首。二月二十二日，嵴山百姓捆绑着孔觊送给王晏，王晏对他说：“这事是孔璪干的，与你无关，你可以写一份自首状，我会为你向皇上申诉。”孔觊说：“江东的谋划部署，没有一件不是我做主的；把罪责推给别人以求活命，这是你们这类人的做法罢了。”王晏于是将他斩首。顾琛、王昙生、袁标等人前往吴喜处请罪，吴喜都宽恕了他们。东部叛军的主将共有七十六人，在战场上斩杀十七人，其余的全部赦免。
薛索儿攻打申阐，久攻不下；派申令孙进入睢陵劝说申阐，申阐出城投降，薛索儿随后下令让申令孙杀死申阐。
山阳王刘休佑驻扎在历阳，辅国将军刘勔进军小岘。殷琰任命的南汝阴太守裴季之献出合肥投降朝廷。
邓琬性情鄙陋昏庸、贪婪吝啬，掌握大权后，父子二人卖官鬻爵，还派婢女仆役到集市上贩卖物品；日夜沉迷于饮酒高歌、下棋赌博，毫无节制；还自视甚高，有宾客登门拜访，往往十几天都见不到他；内部事务全部委托给褚灵嗣等三人，一群小人横行霸道，争相作威作福。于是官吏百姓怨声载道，朝廷内外人心离散。
邓琬派遣孙冲之率领龙骧将军薛常宝、陈绍宗、焦度等一万兵力作为前锋，占据赭圻。孙冲之在途中给晋安王刘子勋写信说：“船只已经备好，粮草武器也已整顿完毕，三军将士斗志昂扬，人人争相效命；正准备沿江东下，直取白下。希望迅速派遣陶亮等大军日夜兼程前来接应，分兵占据新亭、南州，那么一声令下就能平定京都。”刘子勋加封孙冲之为左卫将军；任命陶亮为右卫将军，统领郢、荆、湘、梁、雍五州兵力共计二万人，一同东下。陶亮本无才干谋略，得知建安王刘休仁率军北上，殷孝祖又已赶到，因此不敢前进，驻军于鹊洲。
殷孝祖自恃忠诚节气，便轻视侮辱各位将领，朝廷军队中凡是父子兄弟在南方叛军辖区的，殷孝祖全都想追究治罪。因此人心背离，没人愿意为他效力。宁朔将军沈攸之，对内安抚将士，对外协调各位将领，众人都依赖他。殷孝祖每次作战，常常让仪仗队跟随在身边，军中将士相互议论说：“殷统军可以说是找死的将领啊！如今与叛军交战，却用仪仗队标榜自己，要是有十个擅长射箭的人一起射击他，想不死都难！”三月初三，各路军队水陆并进，攻打赭圻；陶亮等领兵救援，殷孝祖在战场上被流箭射中，战死。军主范潜率领五百人向陶亮投降。人心极为震骇，众人都认为沈攸之应当接替殷孝祖担任主帅。
当时建安王刘休仁驻扎在虎槛，派遣宁朔将军江方兴、龙骧将军襄阳人刘灵遗各自率领三千人赶赴赭圻。沈攸之认为殷孝祖已死，陶亮等人有乘胜进攻的心思，第二天如果不再发起进攻，就会向叛军示弱。江方兴与自己职位相当，必定不会屈居自己之下；军政不统一，是导致失败的原因。于是率领各位军主前往江方兴处说：“如今四方都在反叛，国家所保住的，不过百里之地。只有殷孝祖被朝廷托付重任，可刚一交战，就兵败身亡，文武官员士气低落，朝野上下人心惶惶。事情能否成功，就看明天这一战了；如果作战失利，那么国家大事就无可挽回了。明天的战事，众人有的认为应当由我统领，我自忖懦弱浅薄，才干谋略不如你。现在就推举你为主帅，我们只应当同心协力作战罢了。”江方兴听后十分高兴，便答应了他。沈攸之出来后，各位军主都责怪他，沈攸之说：“我本来是为了救国保家，哪里计较职位的升降！况且我能屈居他之下，他必定不能屈居我之下。共同渡过难关，怎么能计较彼此的异同呢！”孙冲之对陶亮说：“殷孝祖是一员猛将，一战就被杀死，天下大事已经定了，不必再交战，应当直接攻取京都。”陶亮没有听从。
三月初四，江方兴率领各路军队进军交战，建安王刘休仁又派遣军主郭季之、步兵校尉杜幼文、屯骑校尉垣恭祖、龙骧将军京兆人段佛荣等三万人前往会合作战，从寅时到午时，大败叛军，追击到姥山后返回。杜幼文是杜骥的儿子。
孙冲之在湖口、白口修筑两座城池，军主竟陵人张兴世攻下了这两座城。
三月初五，明帝下诏任命沈攸之为辅国将军、假节，接替殷孝祖都督前锋诸军事。
陶亮得知湖口、白口两座城池失守，大为恐惧，急忙召孙冲之返回鹊尾，留下薛常宝等人驻守赭圻；原先在姥山及各山冈设置的营寨，也全部撤回，合力据守浓湖。
当时战事大规模兴起，国家财政不足，朝廷招募百姓捐献钱财粮食，赏赐给他们荒芜的县、郡，或者授予五品至三品不等的散官爵位。
军中粮食短缺，建安王刘休仁安抚慰问将士，平均分配粮食物资，哀悼死者、慰问伤员，亲自抚恤阵亡将士家属；因此十万大军，没有一人离心离德。
邓琬派遣豫州刺史刘胡率领三万人、铁甲骑兵二千人，向东驻扎在鹊尾，加上原有兵力共计十余万人。刘胡是老将，勇猛强健且富有谋略，屡立战功，将士们都畏惧他。司徒中兵参军冠军人蔡那，子弟留在襄阳，刘胡每次作战，都把他们悬挂在城外；蔡那照样奋勇作战，毫不顾及。吴喜平定三吴地区后，率领所部五千人，连同运输的物资粮草，抵达赭圻。
薛索儿率领一万多步兵骑兵从睢陵渡过淮河，进逼青、冀二州刺史张永的军营。三月初九，明帝下诏任命南徐州刺史桂阳王刘休范统领北讨诸军事，进军占据广陵；又下诏令萧道成领兵救援张永。
三月十一日，寻阳王刘子房被押送到建康，皇上宽恕了他，将其爵位贬为松滋侯。
三月十三日，北魏任命陕西王源贺为太尉。
明帝派遣宁朔将军刘怀珍率领龙骧将军王敬则等五千步兵骑兵，协助刘勔讨伐寿阳，斩杀庐江太守刘道蔚。刘怀珍是刘善明的侄子。
中书舍人戴明宝向皇上启奏，派遣军主竟陵人黄回招募士兵，击杀了寻阳政权任命的马头太守王广元。
前奉朝请、寿阳人郑黑，在淮河上游起兵响应建康朝廷，向东抵御殷琰，向西抗拒常珍奇；三月十八日，任命郑黑为司州刺史。
这时，殷琰的部将刘顺、柳伦、皇甫道烈、庞天生等人率领八千步兵骑兵向东占据宛唐；刘勔率领各路军队一同进军，在距离刘顺几里的地方扎营。当时殷琰派遣的各路军队，都受刘顺调度，但因皇甫道烈是当地豪强，柳伦是朝廷派来的人，刘顺出身低微，所以唯独不让他指挥这两支军队。刘勔刚到，营寨壕沟还没修筑好；刘顺想趁机进攻，皇甫道烈、柳伦不同意，刘顺无法单独进军，只好作罢。刘勔的营寨建成后，已无法强攻，双方于是陷入相持对峙。
三月二十五日，朝廷禁止使用新铸的钱币，只准使用古钱。
此时，沈攸之率领各路军队围攻赭圻。薛常宝等人粮食耗尽，向刘胡求救；刘胡用布袋装米，系在木筏和船腹上，假装船翻了，让米顺着水流漂向下游，以此供应赭圻守军。沈攸之怀疑其中有诈，便派人打捞船只和木筏，缴获了大量袋装大米。三月二十九日，刘胡率领一万步兵，连夜劈山开路，用布袋运米前往赭圻送粮。黎明时分，抵达城下，还隔着一条小壕沟，无法进城。沈攸之率领各路军队进行截击，双方展开殊死搏斗，刘胡的军队大败，丢弃粮食铠甲，沿山逃走，被斩杀和俘虏的人很多。刘胡本人也受伤了，勉强才逃回营寨。薛常宝等人对此十分惶恐，到了夏季四月初四，他们打开城门突围，逃回刘胡军中。沈攸之攻克赭圻城，斩杀宁朔将军沈怀宝等人，接纳投降士兵几千人。陈绍宗独自乘船逃往鹊尾。建安王刘休仁从虎槛进军驻扎在赭圻。
此时，刘胡等人的兵力仍然强盛。明帝想安抚人心，便派遣吏部尚书褚渊前往虎槛，选拔任用将士。当时因军功被授予官职的人很多，木板官印供应不足，开始使用黄纸书写任命状。
邓琬以晋安王刘子勋的名义，征召袁顗南下寻阳，袁顗率领雍州的全部兵力日夜兼程东下。邓琬任命黄门侍郎刘道宪代理荆州事务，侍中孔道存代理雍州事务。上庸太守柳世隆乘虚袭击襄阳，但没有攻克。柳世隆是柳元景弟弟的儿子。
散骑侍郎明僧暠担任青州刺史。平原、乐安二郡太守王玄默占据琅邪，清河、广川二郡太守王玄邈占据盘阳城，高阳、勃海二郡太守刘乘民占据临济城，都起兵响应建康朝廷。王玄邈是王玄谟的堂弟；刘乘民是刘弥之的侄子。沈文秀派遣军主解彦士攻打北海，攻克城池，杀死刘弥之。刘乘民的堂弟刘伯宗，召集乡邻，重新夺回北海，随后领兵向青州治所东阳城进军。沈文秀出兵抵抗，刘伯宗战死。明僧暠、王玄默、王玄邈、刘乘民联合兵力攻打东阳城，每次交战都被沈文秀击败，溃散后又重新集结，这样反复了十多次，最终没能攻克。
此时，杜叔宝认为朝廷军队驻守历阳，不能迅速前进；等到刘勔等人率军抵达，寿阳上下震动恐慌。刘顺等人出发时，只带了一个月的粮食，与刘勔相持日久，粮食耗尽。杜叔宝出动一千五百辆车，装满大米送给刘顺，并亲自率领五千精兵护送。吕安国得知后，对刘勔说：“刘顺有八千精锐士兵，而我们的兵力还不到他的一半。双方相持已久，强弱悬殊，如果再拖延下去，我们就无法立足了。我们所依赖的，是他们的粮食即将耗尽，而我们的粮食还有剩余。如果让杜叔宝的米运到，不仅难以再图谋击败他们，我们也无法持久坚守。如今只有从小路袭击他们的运米车队，出其不意，如果能制服他们，刘顺的军队就会不战而逃。”刘勔认为他说得对，于是用疲弱的士兵留守营寨，挑选一千名精兵配给吕安国和龙骧将军黄回，让他们从小路绕到刘顺后方，在横塘截击运米车队。
吕安国出发时，带了两天的熟食；等到食物吃完了，杜叔宝还没到，将士们便想返回，吕安国说：“你们早上已经吃了一顿饭。今晚运米车队一定会到；如果不到，夜里再回去也不晚。”到了夜晚，杜叔宝果然赶到了，把运米车排列成箱形阵，自己率领士兵在阵外游动警戒。幢主杨促怀率领五百人在前面开路，吕安国、黄回等人袭击斩杀了他，把他的士兵全部消灭。等到杜叔宝赶到后，黄回想乘胜进攻，吕安国说：“他会自己逃走的，不必再攻打他了。”于是率军后退三十里，扎营过夜。夜里派遣骑兵侦察，杜叔宝果然丢弃运米车队逃走了。吕安国又连夜前去烧毁运米车，驱赶着两千多头牛返回。
五月初一，夜里，刘顺的军队溃散，刘顺逃往淮西投奔常珍奇。于是刘勔擂鼓进军，向寿阳进发。杜叔宝收拢百姓和逃散的士兵，环城固守；刘勔与各路军队在城外分别扎营。
山阳王刘休佑给殷琰写信，向他陈述利害得失，明帝又派遣御史王道隆携带诏书前往寿阳，赦免殷琰的罪责。刘勔也给殷琰写信，并把殷琰哥哥殷瑗的儿子殷邈的信一起送去。殷琰与杜叔宝等人都有投降的意愿，但众人意见不一，于是又环城固守。
弋阳西山蛮族首领田益之起兵响应建康朝廷，明帝下诏任命田益之为辅国将军，都督弋阳西山事务。五月初六，任命辅国将军沈攸之为雍州刺史。五月二十一日，任命尚书左仆射王景文为中军将军。五月二十四日，任命宁朔将军刘乘民为冀州刺史。
五月二十八日，将昭太后安葬在修宁陵。
此时，张永、萧道成等人与薛索儿交战，大败薛索儿，薛索儿退保石梁；粮食耗尽后军队溃散，逃向乐平，被申令孙的儿子申孝叔斩杀。薛安都的儿子薛道智逃到合肥，向裴季之投降。傅灵越逃到淮西，被武卫将军沛郡人王广之活捉，押送到刘勔那里。刘勔责问他反叛的罪行，傅灵越说：“九州都起来反抗，难道唯独我一个人吗！薛公不能专任有智有勇的人，反而托付给子侄，这是他失败的原因。人生终究一死，我实在没有脸面乞求活命。”傅灵越被押送到建康，明帝想赦免他，傅灵越始终不改供词，于是将他处死。
邓琬因刘胡与沈攸之等人相持不下，久战不决，于是加授袁顗都督征讨诸军事。六月十八日，袁顗率领一千艘楼船，两万士兵，进入鹊尾。袁顗本来就没有将领的谋略，性情又怯懦，在军中从不穿军装，谈话也不涉及战阵之事，只知赋诗谈论义理，不再安抚接见各位将领；刘胡每次商议军事，袁顗的回应都很简略。由此大失人心，刘胡常常咬牙切齿，心怀怨恨。刘胡因南方的粮食还没运到，士兵缺乏粮草，就向袁顗借襄阳的物资，袁顗不同意，还说：“京都的两处宅院还没建成，正需要料理。”又听信往来之人的传言，说“建康米价昂贵，一斗达到几百钱”，认为朝廷军队会不攻自溃，于是手握重兵等待时机。
田益之率领一万多蛮族士兵围攻义阳，邓琬派遣司州刺史庞孟虬率领五千精兵救援，田益之不战而溃。
安成太守刘袭、始安内史王识之、建安内史赵道生，都献出本郡投降朝廷。刘袭是刘道怜的孙子。
这时，萧道成的长子萧赜担任南康赣县令，邓琬派遣使者将他逮捕关押。萧赜的门客兰陵人桓康挑着萧赜的妻子裴氏和儿子萧长懋、萧子良逃到山中，与萧赜的族人萧欣祖等人结交宾客一百多人，攻打南康郡城，攻破监狱救出萧赜。南康相沈肃之率领将士追赶萧赜，萧赜与他交战，将他擒获。萧赜自称宁朔将军，占据郡城起兵，与刘袭等人相互呼应。邓琬任命中护军殷孚为豫章太守，都督上游五郡，以防备刘袭等人。
衡阳内史王应之起兵响应建康，在长沙袭击湘州行事何慧文。王应之与何慧文放下兵器近身搏斗，王应之砍伤何慧文八处，何慧文斩断王应之的脚，将他杀死。
始兴人刘嗣祖等人占据郡城起兵响应建康，广州刺史袁昙远派遣将领李万周等人讨伐。刘嗣祖欺骗李万周说“寻阳已经平定”，李万周返回袭击番禺，擒获袁昙远，将他斩首。皇上任命李万周代理广州事务。
起初，武都王杨元和治理白水，势力微弱无法自立，于是放弃封国投奔北魏。杨元和的堂弟杨僧嗣重新自立，驻扎在葭芦。费欣寿抵达巴东，巴东人任叔儿占据白帝城，自称辅国将军，攻打费欣寿，将他斩杀，任叔儿于是据守三峡。萧惠开又派遣治中程法度率领三千士兵出兵梁州，杨僧嗣率领氐族各部截断他的去路，并秘密派遣使者向朝廷报告。秋季七月十二日，朝廷任命杨僧嗣为北秦州刺史、武都王。
此时，各路军队与袁顗在浓湖相持，久战不决。龙骧将军张兴世建议说：“叛军占据上游，兵力强盛，地势优越。我们虽然能够坚守，却难以制服他们。如果派遣几千奇兵暗中绕到他们上游，凭借险要地势扎营，见机行事，让他们首尾难以兼顾，进退犹豫不决，中流被截断后，粮草运输自然困难，这是制服叛军的奇计。钱溪江岸最狭窄，距离大军不远，下游有洄流，船只下行必定会在此停泊，又有横浦可以隐藏船只，一千人守卫险要之地，一万人也无法通过。这是最关键的战略要地。”沈攸之、吴喜都赞同他的计策。恰逢庞孟虬领兵前来援助殷琰，刘勔派遣使者紧急求援，建安王刘休仁想派遣张兴世前去救援。沈攸之说：“庞孟虬的军队不过是乌合之众，必定成不了大事，派遣别的将领率领几千步兵骑兵，就足以制服他。张兴世这次行动，是关系安危的关键，绝不能停止。”于是派遣段佛荣领兵救援刘勔，同时挑选七千名战士、二百艘轻便战船配给张兴世。
张兴世率领军队逆流而上，不久又退回来，这样反复了好几天。刘胡得知后，笑着说：“我尚且不敢越过他们南下夺取扬州，张兴世是什么人，竟敢轻率地想占据我的上游！”于是没有防备。一天夜里四更时分，恰逢顺风，张兴世下令扬帆直进，渡过湖口、白口，经过鹊尾。刘胡察觉后，才派遣将领胡灵秀领兵在东岸侧翼跟随前进。七月十三日傍晚，张兴世驻扎在景洪浦，胡灵秀也在此停留。张兴世暗中派遣将领黄道标率领七十艘战船径直奔赴钱溪，修筑营寨；七月十四日，张兴世领兵进占钱溪，胡灵秀无法阻止。七月十五日，刘胡亲自率领二十六支水军和步兵前来攻打钱溪。将士们想迎击固守，张兴世阻止说：“叛军还很远，士气旺盛，箭矢密集；密集的箭矢容易耗尽，旺盛的士气也容易衰落，不如等待他们。”下令将士们像往常一样修筑城池。不久刘胡的军队逼近，船只进入洄流；张兴世命令寿寂之、任农夫率领几百名壮士发起攻击，各路军队相继跟进，刘胡的军队大败而逃，被斩首几百人，刘胡收拢军队退下。当时张兴世的营寨还没加固，建安王刘休仁担心袁顗会合力再次攻打钱溪，想分散他们的兵力。七月十六日，下令沈攸之、吴喜等人用蒙皮战船进攻浓湖，斩杀和俘虏一千多人。当天，刘胡率领两万步兵、一千铁甲骑兵，想再次攻打张兴世。还没到钱溪几十里，袁顗因浓湖危急，急忙派人追回刘胡，钱溪的营寨因此得以建成。刘胡派人散布谣言“钱溪已经平定”，朝廷军队都很害怕，沈攸之说：“不对。如果钱溪真的战败，一万人中应该有一个人逃回来报告；这必定是他们作战失利，故意散布谣言来迷惑我们。”于是下令军中不得妄动；不久钱溪的捷报就传到了。沈攸之把钱溪送来的刘胡军队的耳鼻展示给浓湖的叛军看，袁顗看到后十分惊骇恐惧。沈攸之傍晚时分领兵返回。
龙骧将军刘道符攻打山阳，程天祚请求投降。
庞孟虬进军到弋阳，刘勔派遣吕安国等人在蓼潭迎击，大败庞孟虬，庞孟虬逃往义阳。王玄谟的儿子王昙善起兵占据义阳响应建康，庞孟虬逃到蛮族地区死去。
刘胡派遣辅国将军薛道标袭击合肥，杀死汝阴太守裴季之，刘勔派遣辅国将军垣闳反击。垣闳是垣阆的弟弟；薛道标是薛安都的儿子。
淮西人郑叔举兵攻打常珍奇，以响应郑黑；七月二十四日，朝廷任命郑叔举为北豫州刺史。崔道固遭到当地百姓攻打，关闭城门固守。明帝派遣使者安抚慰问，崔道固请求投降。七月二十七日，朝廷重新任命崔道固为徐州刺史。这时，皇甫道烈等人得知庞孟虬兵败身亡，便一同打开城门出城投降。
张兴世占据钱溪后，浓湖的叛军缺乏粮食。邓琬大规模运送物资粮草，因畏惧张兴世，所以不敢前进。刘胡率领四百艘轻便战船，从鹊头内侧航道想要攻打钱溪，不久对长史王念叔说：“我从小习惯步兵作战，不熟悉水战。步兵作战时，我常常在数万人之中；水战却在一艘战船之上，每艘船各自前进，不再相互配合，我身边只有三十人，这不是万全之策，我不做这样的事。”于是借口身患疟疾，停留在鹊头不再前进，派遣龙骧将军陈庆率领三百艘战船前往钱溪，告诫陈庆：“不必交战。张兴世是我熟悉的人，他自然会逃走。”陈庆抵达钱溪，驻扎在梅根。
刘胡派遣别将王起率领一百艘战船攻打张兴世，张兴世迎击王起，大败叛军。刘胡率领剩余的战船疾驰返回，对袁顗说：“张兴世的营寨已经建成，不能仓促攻打；昨天的小规模交战，不足以造成损失。陈庆已经与南陵、大雷各路军队一同阻断了他的上游，大军驻扎在这里，鹊头的各位将领又截断了他的下游；他已经陷入包围之中，不必再担忧。”袁顗恼怒刘胡不作战，对他说：“粮草运输被阻断，该怎么办？”刘胡说：“他尚且能逆流越过我军向上游进军，我们的粮草为什么不能顺流越过他向下游运送呢！”于是派遣安北府司马沈仲玉率领一千人徒步前往南陵迎接粮草。
沈仲玉抵达南陵，装载了三十万斛大米，几十船钱财布匹，竖起木栅作为营垒，打算强行通过钱溪。行进到贵口，不敢继续前进，派遣密使报告刘胡，让他派遣重兵前来接应。张兴世派遣寿寂之、任农夫等人率领三千人赶到贵口袭击沈仲玉，沈仲玉逃回袁顗的营寨，物资全部被缴获；刘胡的军队极为惊骇恐惧，将领张喜前来投降。
镇东中兵参军刘亮进军逼近刘胡的营寨，刘胡无法控制局势。袁顗恐惧地说：“叛军已经攻入心腹之地，我们怎么能活下去！”刘胡暗中谋划逃走，八月二十四日，欺骗袁顗说：“我想再率领两万步兵骑兵，北上攻取钱溪，同时接运大雷剩余的粮草。”让袁顗挑选全部马匹配给他。当天，刘胡丢下袁顗离去，径直前往梅根。先命令薛常宝准备船只，调动南陵的各路军队，烧毁大雷的各座城池后逃走。到了夜里，袁顗才得知此事，大怒，骂道：“今年被这小子耽误了！”叫来自己平时乘坐的好马“飞燕”，对部下说：“我要亲自去追击他！”于是也逃走了。
八月二十五日，建安王刘休仁领兵进入袁顗的营寨，接纳十万投降士兵，派遣沈攸之等人追击袁顗。袁顗逃到鹊头，与戍主薛伯珍以及所率领的几千人一同离去，打算前往寻阳。夜里，停留在山间，杀马犒劳将士，回头对薛伯珍说：“我不是不能死；只是想亲自到寻阳，向主上谢罪，然后再自刎。”于是激昂地呵斥身边的人索要符节，再也没有人回应。到了黎明，薛伯珍请求屏退旁人议事，随即斩杀袁顗的首级，前往钱溪投奔马军主襄阳人俞湛之。俞湛之于是斩杀薛伯珍，将两人的首级一同送去，作为自己的功劳。
刘胡率领两万人前往寻阳，欺骗晋安王刘子勋说：“袁顗已经投降，军队都溃散了，只有我率领部下独自返回；应当迅速部署，准备一战的物资。我会驻守湓城，誓死不背叛。”于是在长江外侧连夜赶往沔口。
邓琬得知刘胡逃走，忧愁惶恐无计可施，急忙召集中书舍人褚灵嗣等人商议，众人都不知该怎么办。张悦谎称生病，召集邓琬商议事务，命令手下在帐后埋伏武士，告诫他们：“如果听到我喊拿酒，就出来动手。”邓琬到达后，张悦说：“你最先发起这个谋反计划，如今事情危急，有什么计策？”邓琬说：“只能斩杀晋安王，封存府库，以此向朝廷谢罪。”张悦说：“难道可以出卖殿下以求活命吗！”随即喊拿酒。张悦的儿子张洵持刀冲出，斩杀邓琬。中书舍人潘欣之得知邓琬死去，赶忙领兵赶来。张悦派人对他说：“邓琬谋反，如今已经被斩首。”潘欣之才撤兵返回。接着，张悦逮捕邓琬的儿子，一并杀死。随后张悦独自乘船带着邓琬的首级疾驰东下，前往建安王刘休仁处投降。
这时，寻阳陷入混乱。蔡那的儿子蔡道渊在寻阳被关押在作坊里，挣脱枷锁进入城中，抓获刘子勋，将他囚禁起来。沈攸之等各路军队抵达寻阳，斩杀晋安王刘子勋，将首级传送到建康，刘子勋当时十一岁。
起初，邓琬派遣临川内史张淹从鄱阳山路进入三吴地区，驻扎在上饶，得知刘胡战败，军副鄱阳太守费晔斩杀张淹投降。张淹是张畅的儿子。
废帝在位时，士大夫们畏惧灾祸，都想远离京城。到这时，那些流亡在外遭遇战乱的人，一百个中没有一个存活，众人这才佩服蔡兴宗的先见之明。
九月初八，朝廷任命山阳王刘休佑为荆州刺史。
九月初九，朝廷解除戒严，实行大赦。
九月十六日，司徒刘休仁抵达寻阳，派遣吴喜、张兴世前往荆州，沈怀明前往郢州，刘亮及宁朔将军南阳人张敬儿前往雍州，孙超之前往湘州，沈思仁、任农夫前往豫章，平定剩余的叛军。
刘胡逃到石城，被抓获后斩首。郢州行事张沈乔装成僧人，暗中逃走，被追兵抓获杀死。荆州行事刘道宪得知浓湖平定，便遣散士兵，派遣使者向朝廷请罪。荆州治中宗景等人领兵入城，杀死刘道宪，抓获临海王刘子顼投降。孔道存得知寻阳已经平定，便派遣使者请求投降；不久听说柳世隆、刘亮即将到来，部众全部逃散，孔道存和三个儿子都自杀身亡。皇上认为何慧文兼具文武才能，派吴喜宣布圣旨赦免他。何慧文说：“我既已背叛朝廷，亲手杀害忠义之人，还有什么脸面见天下士人！”于是自杀。安陆王刘子绥、临海王刘子顼、邵陵王刘子元都被赐死，刘顺及留在荆州的残余党羽全部被处死。朝廷下诏追赠各位为守节而死的大臣，对有功之人分别给予不同的封赏。
九月二十五日，北魏开始设立郡学，设置博士、助教和生员，这是采纳了中书令高允、相州刺史李欣的建议。李欣是李崇的儿子。
明帝诛杀晋安王刘子勋等人后，对待世祖的其他儿子仍像往常一样。司徒刘休仁从寻阳返回，对明帝说：“松滋侯刘子房兄弟还在，将来会成为国家的隐患，应当尽早处置他们。”冬季十月初一，松滋侯刘子房、永嘉王刘子仁、始安王刘子真、淮南王刘子孟、南平王刘子产、庐陵王刘子舆、刘子趋、刘子期、东平王刘子嗣、刘子悦都被赐死，镇北咨议参军路休之、司徒从事中郎路茂之、兖州刺史刘祗、中书舍人严龙都因牵连被杀。世祖的二十八个儿子至此全部死去。刘祗是刘义欣的儿子。
这时，刘勔围攻寿阳，从初春到冬末，对内攻城、对外防御，每战必胜，凭借宽厚赢得将士的人心。寻阳平定后，皇上让中书省起草诏书晓谕殷琰，蔡兴宗说：“天下已经平定，这是殷琰反思过错的时候。陛下应当亲手写下几行诏书来安慰引导他。如今直接让中书省起草诏书，他必定怀疑不是真的，这不是迅速平定一方战乱的办法。”明帝没有听从。殷琰收到诏书，认为是刘勔伪造的，所以不敢投降。杜叔宝封锁寻阳战败的消息，有传播消息的人立即被杀，防守更加坚固。凡是有投降的人，明帝就把他们送到寿阳城下，让他们与城中人交谈，因此城中人心离散沮丧。
殷琰想向北魏投降，主簿谯郡人夏侯详劝说殷琰：“今天的举动，本来是为了效忠气节。如果国家有了正统君主，就应当归附朝廷，怎么能向北称臣、穿异族服装呢！况且如今魏军近在淮河岸边，官军还不确定我们的去向，如果派遣使者归顺朝廷，朝廷必定会隆重安抚接纳，岂止是免除罪责而已。”殷琰于是派夏侯详出城拜见刘勔，夏侯详劝说刘勔：“如今城中士民明知处境困窘却仍固守，是害怕将军诛杀，都想归附北魏。希望将军放宽刑罚、予以赦免，他们就会争相前来投降了。”刘勔答应了，让夏侯详到城下，呼喊城中人，传达刘勔的意思。十月初二，殷琰率领将领僚属反绑双手出城投降，刘勔对他们全部加以安抚，没有杀戮一人。进入城中后，刘勔约束将士，对士民的财物秋毫无犯，寿阳人大为喜悦。此时，魏军抵达师水，准备救援寿阳；得知殷琰已经投降，于是劫掠义阳几千人后离去。很久以后，殷琰又入朝为官，官至少府后去世。
这时，萧惠开在益州，大量施行刑罚诛杀，蜀人猜疑怨恨。得知费欣寿战败阵亡，程法度无法前进，于是晋原一郡反叛，其他各郡纷纷响应，合兵围攻成都。城中的北方士兵不过两千人，萧惠开将所有蜀人全部派出城，独自与北方士兵坚守。蜀人得知寻阳已经平定，争相想要屠城，部众达到十几万人。萧惠开每次派兵出战，没有不胜的。
这时，明帝派遣萧惠开的弟弟萧惠基从陆路出使成都，赦免萧惠开的罪责。萧惠基抵达涪城，蜀人阻拦扣留萧惠基，不让他前进。萧惠基率领部下攻击他们，斩杀首领，然后才得以继续前进。萧惠开奉圣旨投降，成都的包围得以解除。
明帝又派遣萧惠开的同宗萧宝首从水路前往益州慰劳。萧宝首想把平定蜀地作为自己的功劳，进一步鼓动蜀人，让他们攻打萧惠开。于是蜀地各处纷纷起兵，凡是离散的人一时间全部集结，与萧宝首一起进逼成都，部众号称二十万。萧惠开想攻击他们，将领僚属都说：“如今慰劳的使者到来却抵抗他，怎么向朝廷表明清白？”萧惠开说：“如今奏表书信的通道被阻断，不作战怎么能打通与京城的联系？”于是派遣宋宁太守萧惠训等人率领一万士兵迎战，大败叛军，生擒萧宝首，将他囚禁在成都，并派遣使者向朝廷说明情况。明帝派人将萧宝首押送到建康，召萧惠开返回建康。抵达后，明帝询问他起兵的情况。萧惠开说：“我只知道叛逆与顺从，不知道天命；况且不是我引发的战乱，也不是我平定的战乱。”明帝听后赦免了他。
这一年，朝廷侨置兖州，治所设在淮阴；徐州治所设在钟离；青、冀二州共设一名刺史，治所设在郁洲。郁洲在海中，周长几百里，用石头垒成城墙，高八九尺，虚设郡县，流亡的百姓没有多少。
张永、沈攸之进军逼近彭城，驻扎在下磕，分别派遣羽林监王穆之率领五千士兵在武原守卫粮草辎重。
北魏的尉元抵达彭城，薛安都出城迎接。尉元派遣李璨与薛安都先进入城中，接管城门钥匙；另外派遣孔伯恭率领两千精锐士兵安抚内外，然后才入城。当天夜里，张永攻打南门，没能攻克而撤退。
尉元对薛安都不加礼遇，薛安都后悔投降，又谋划反叛北魏；尉元察觉后，薛安都未能付诸实施。薛安都用重金贿赂尉元等人，把罪责推到女婿裴祖隆身上并杀死他。尉元让李璨与薛安都守卫彭城，自己领兵攻击张永，切断他的粮道，又在武原击败王穆之。王穆之率领剩余部众前往投奔张永，尉元进军攻打张永的军队。